医学学科门类下设：基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、中医学、中西医结合、药学、中药学、特种医学、医学技术、护理学、科学技术史、生物医学工程13个一级学科。
59个二级学科，其中基础医学6个，临床医学18个，口腔医学2个，公共卫生与预防医学6个，中医学13个，中西医结合2个，药学6个，中药学1个，特种医学1个，医学技术1个，护理学1个，科学技术史1个，生物医学工程1个。
学科门类为：10 医学
一级学科为：1001 基础医学
二级学科为：100100 基础医学
100101 人体解剖与组织胚胎学
100102 免疫学
100103 病原生物学
100104 病理学与病理生理学
100105 法医学
100106 放射医学
一级学科为：1002 临床医学
二级学科为：100200 临床医学
100201 内科学
100202 儿科学
100203 老年医学
100204 神经病学
100205 精神病与精神卫生学
100206 皮肤病与性病学
100207 影像医学与核医学
100208 临床检验诊断学
100210 外科学
100211 妇产科学
100212 眼科学
100213 耳鼻咽喉科学
100214 肿瘤学
100215 康复医学与理疗学
100216 运动医学
100217 麻醉学
100218 急诊医学
一级学科为：1003 口腔医学
二级学科为：100300 口腔
医学
100301 口腔基础医学
100302 口腔临床医学
一级学科为：1004 公共卫生与预防医学
二级学科为：100400 公共卫生与预防医学
100401 流行病与卫生统计学
100402 劳动卫生与环境卫生学
100403 营养与食品卫生学
100404 儿少卫生与妇幼保健学
100405 卫生毒理学
100406 军事预防医学
一级学科为：1005 中医学
二级学科为：100500 中医学
100501 中医基础理论
100502 中医临床基础
100503 中医医史文献
100504 方剂学
100505 中医诊断学
100506 中医内科学
100507 中医外科学
100508 中医骨伤科学
100509 中医妇科学
100510 中医儿科学
100511 中医五官科学
100512 针灸推拿学
100513 民族医学（含：藏医学、蒙医学等）
一级学科为：1006 中西医结合
二级学科为：100600 中西医结合
100601 中西医结合基础
100602 中西医结合临床
一级学科为：1007 药学
二级学科为：100700 药学
100701 药物化学
100702 药剂学
100703 生药学
100704 药物分析学
100705 微生物与生化药学
100706 药理学
一级学科为：1008 中药学
二级学科为：100800 中药学
一级学科为：1009 特种医学
二级学科为：100900 特种医学
一级学科为：1010 医学技术
二级学科为：101000 医学技术
一级学科为：1011 护理学
二级学科为：1011L1 护理学
一级学科为：1071 科学技术史
二级学科为：107100 科学技术史
一级学科为：1072 生物医学工程
二级学科为：107200 生物医学工程
学科门类，用两位代码表示
一级学科是学科大类，用四位代码表示。
二级学科是其下的学科小类，用六位代码表示。
通俗的来说，可以理解为一级学科是一个专业，二级学科是不同的研究方向。
医学学科门类专业划分：
学术硕士专业划分：
1001 基础医学包含专业：
（1）比较医学、（2）病理生理学、（3）病理学、（4）病理学与病理生理学、（5）病原生物学、（6）法医学、（7）放射医学、（8）分子医学、（9）妇产科学基础、（10）干细胞与再生医学、（11）高原医学、（12）基础医学、（13）精准医学、（14）口腔生物医学、（15）免疫学、（16）人类生殖学、（17）人体解剖与组织胚胎学、（18）人体生理学、（19）人文医学、（20）神经科学、（21）生殖医学、（22）数字医学、（23）药物毒理学、（24）医学蛋白质组学、（25）医学分子生物学、（26）医学化学、（27）医学基础药理学、（28）医学教育学、（29）医学伦理学、（30）医学神经生物学、（31）医学生理学、（32）医学生理学与生物化学、（33）医学生物化学、（34）医学生物化学与分子生物学、（35）医学生物化学与细胞生物学、（36）医学实验学、（37）医学系统生物学、（38）医学细胞生物学、（39）医学细胞生物学与遗传学、（40）医学心理学、（41）医学信息学、（42）医学药理学、（43）医学遗传学、（44）医学遗传学与医学细胞生物学、（45）再生医学、（46）转化医学、（47）组织工程学。
1002 临床医学包含专业：
（1）包虫病学、（2）比较医学、（3）变态反应学、（4）创伤医学、（5）代谢性血管病学、（6）儿科学、（7）儿内科学、（8）耳鼻咽喉科学、（9）妇产科学、（10）干细胞与再生医学、（11）感染病学、（12）急危重症护理学、（13）急诊医学、（15）疾病分子与转化医学、（16）计算医学、（17）健康大数据与智能医学、（18）健康管理、（19）健康管理学、（20）介入放射学、精神病与精神卫生学、精准医学、康复医学与理疗学、口腔整形美容学、老年医学、（21）临床病理学、（22）临床病理学与病原生物学、（23）临床护理学、（24）临床检验诊断学、（25）临床口腔医学、（26）临床心理学、（27）临床研究方法学、（28）临床药物与器械评价学、（29）临床药学、（30）临床医学、（31）临床遗传学、（32）临床营养学、（33）临床中西医、（34）临床中西医结合、（35）麻醉学、（36）蒙西医结合护理学、（37）母婴医学、（38）内科学、（39）皮肤病与性病学、（40）全科医学、（41）人工智能、（42）人类重大疾病生物治疗、（43）人文医学、（44）神经病学、（45）生殖医学、（46）输血医学、（47）睡眠医学、（48）疼痛医学、（49）听力学、（50）听力与言语康复学、（51）外科学、（52）围术期医学、（53）血管病学、（54）循证医学、（55）眼科学、（56）眼视光学、（57）医学设备技术学、（58）医学心理学、（59）医学信息学、（60）医学信息学（临床信息、信息与决策、信息系统、信息标准）、（61）移植科学与工程学、（62）影像医学与核医学、（63）运动医学、（64）再生医学、（65）中西医结合治疗学、（66）肿瘤学、（67）重症医学、（68）转化医学。
1003 口腔医学包含专业：
（1）儿童口腔医学、（2）口腔基础医学、（3）口腔临床医学、（4）口腔内科学、（5）口腔修复学、（6）口腔医学、（7）口腔正畸学、（8）口腔颌面外科学、（9）牙周病学。
1004 公共卫生与预防医学包含专业：
（1）儿少卫生与妇幼保健学、（2）公共卫生与社区管理、（3）公共卫生与预防医学、（4）健康教育与健康促进、（5）健康与社会行为学、（6）军事心理与认知科学、（7）军事预防医学、（8）军事作业医学、（9）劳动卫生与环境卫生学、（10）老年保健与姑息医学、（11）流行病与卫生统计学、（12）全球健康学、（13）人文医学、（14）社区医学与健康教育学、（15）生命伦理学、（16）卫生毒理学、（17）卫生防护防疫技术与装备、（18）卫生检验学、（19）卫生检验与检疫、（20）卫生检验与检疫学、（21）卫生事业管理、（22）卫生事业管理学、（23）卫生应急管理、（24）卫生政策与管理、（25）卫生政策与管理学、（26）心理卫生学、（27）医学实验技术、（28）医学心理学、（29）医学信息学医药信息管理、（30）营养与食品卫生学、（31）预防药物学、（32）职业卫生安全、（33）转化医学。
1005 中医学包含专业：
（1）敦煌医学、（2）方剂学、（3）回族医学、（4）健康管理学、（5）民族医学（含:藏医学、蒙医学等）、（6）医学社会学、（7）医药卫生法学、（8）针灸推拿学、（9）中医儿科学、（10）中医翻译学、（11）中医妇科学、（12）中医肛肠病学、（13）中医工程、（14）中医骨伤科学、（15）中医管理学、（16）中医护理学、（17）中医基础理论、（18）中医康复学、（19）中医老年病学、（20）中医临床基础、（21）中医临床药学、（22）中医内科学、（23）中医人类学、（24）中医体质学、（25）中医外科学、（26）中医文化学、（27）中医五官科学、（28）中医心理学、（29）中医信息学、（30）中医学、（31）中医亚健康学、（32）中医眼科学、（33）中医养生康复学、（34）中医养生学、（35）中医药膳学、（36）中医药事业管理、（37）中医药外语、（38）中医药卫生事业管理、（39）中医药信息学、（40）中医医史文献、（41）中医优势治疗技术、（42）中医诊断学、（43）中医肿瘤学。